Шишкин Юрий Федорович — стольник, воевода в Арзамасе, Туруханске, Иркутске, Якутске.

В 1680 году стльник Юрий Шишкин назначен воеводой на арзамасские и сергацкие будные станы к поташному делу.
В 1682 году воевода Юрий Шишкин был назначен писцом(для организации переписи земель) в Арзамас.
1697—1699. Юрий Федорович Шишкин воевода в Туруханске.
В 1699 году Мангазейский воевода Юрий Шишкин со своим сыном Михаилом был назначен на воеводство в Иркутск. Однако самому Юрию Шишкину до вступления в воеводскую должность было предписано прибыть в Красноярск для участия в расследовании дела о злоупотреблениях бывшего красноярского воеводы Мирона Башковского. В Иркутск для приемки дел был послан только его сын Михаил Шишкин. По прибытии в июне 1702 года на воеводство в Иркутск Юрия Шишкина, Михаилу было велено быть с отцом в Иркутске в товарищах. В Иркутске Юрий Шишкин находился до июля 1704 года, после чего вместе с сыном был направлен на воеводство в Якутск, куда они прибыли 2 июня 1706 года. Как и в Иркутске, так и в Якутском остроге воеводство Юрия и Михаила Шишкиных было отмечено началом каменного строительства в этих городах. В Иркутске был построен каменный гостиный двор, в здании которого, по сведениям иркутского летописца, имелась вложенная в стену каменная плита с вырезанною надписью следующего содержания: «Божею милостью в лето спасения 1704 году, по указу Великого государя, Царя и Великого Князя Петра Алексеевича, построена сия палата при стольнике и воеводе Юрье Федоровиче Шишкине с товарищи». В Якутске Юрий и Михаил Шишкины инициировали идею строительства Троицкого каменного храма (на месте сгоревшей в 1701 г. Троицкой соборной деревянной церкви) и начали сбор средств. 27.06.1708 г. по приглашению воевод иркутский викарный епископ Варлаам Коссовский заложил храм во имя Святой Живоначальной Троицы. Возведение каменного собора стало крупнейшим событием в г. Якутске и в истории православия в Восточной Сибири. Собор вместе с колокольней доминировал над городом и резко выделялся на фоне деревянных построек. В 1707 году в Якутске было построено первое (на всём северо-востоке Азии) каменное здание — Воеводская канцелярия, это первый в России опыт возведения каменного сооружений на вечной мерзлоте. Полуразрушенное здание канцелярии сохранялось вплоть до 1988 г.
К 8 мая 1711 года Юрий Шишкин вместе с сыном, после воеводства в Сибири, были вызваны в «Розряд в Сенат», куда вовремя не явились. За неявку их деревни были «отписаны на государя».
После их прибытия и допроса о причинах опоздания, деревни им были возвращены. После чего 20 мая 1711 года Юрий Шишкин был отослан в Военный приказ, где ему велено быть «при инфантерии комиссаром». 8 августа 1711 года Юрий Шишкин был послан из Военной Канцелярии в Померанию с денежной казной. Денежную казну (50,000 рублей), ему было велено объявить чрезвычайному и полномочному послу, действительному тайному советнику и кавалеру князю Григорью Федоровичу Долгорукому. 28 Февраля 1712 года генерал-лейтенант и кавалер Боур сообщил в Военную Канцелярию, что у Юрия Шишкина денежную казну было поручено принять майорам Устюжскаго полка Михайлу Чирикову, Ростовскаго Федору Сухово-Кабылину. По возвращении в Москву Юрий Шишкин предъявил в Военной канцелярии расписку, от вышеназванных майоров, что «в Прусской земле в местачке Шведах», денежную казну 50,000 рублей у него приняли.
16 июня 1712 года Правительствующий сенат направил стольника Юрия Шишкина в Азовскую губернию комиссаром.
В 1713 году Юрий Шишкин был назначен переписчиком земель в Устюжину Железопольскую.
До настоящего времени сохранилась переписная книга Устюжинского уезда подписанная Ю. Шишкиным.

Упоминается в документах:
 

• 1693 — 1701гг. Докладная выписка, сделанная в Сибирском приказе о судебной расправе среди ясачных людей.
  Сборник документов по истории Бурятии XVII век, Улан-Удэ , Выпуск 1. 1960г.

• 1697 г. Из дела о «бунте заморских казаков» против иркуцкого воеводы Афанасья Савелова 1696г.
  Сборник документов по истории Бурятии XVII век, Улан-Удэ , Выпуск 1. 1960г.
• 1700г. Указ об учинении розыска о злоупотреблениях Красноярских воевод Башковских и Семена Дурново. - Царская грамота красноярскому воеводе по поводу означеннаго указа.
  "Памятники Сибирской истории XVIII века". Книга первая.1882г. Петербург. сс. 38-52
• 1700г. Подтвердительная грамота иркутскому воеводе Юрью Шишкину. О постройке в Иркутске, для безопасности от пожара каменнаго гостинаго двора.
  Зоркин В. Иркутские градоначальники. Кн. первая. Воеводы и вице-губернаторы. (1652-1764) : учеб. пособие / В. Зоркин. - Иркутск : Иркут. гос. ун-т, 2006.
• 1705г. Челобитная енисейского жителя М. Истопникова о разрешении свободной продажи жемчуга, привезенного из Китая А. Королевым и С. Белобородовым
  Н. Ю. Болотина "Еду я для торговаго своего промыслу". Китайские товары в России XVIII в. // Исторический архив, № 4. 2006, с. 179— 180  док. №1.
• 1705г. Грамота в Иркутский острог стольнику и воеводе Лариону Акимовичу Синявину и подьячему Ивану Ипатьеву о присылке к Москве товаров.
  Летопись занятий Археографической комиссии Т.02. 1862г., СПб., «Из сибирских дел, 1705г.» №3, с.71 — 72.
• 1710г. Показание прикащика Анадырскаго острога Ефима Петрова о сношениях с немирными Коряками и Чукчами, строении острога на р. Пенжине и проч.
  Памятники сибирской истории XVIII века. СПб., 1885. Кн. 2. С.528 – 530
• 1712г. Отписка якутских воевод об учинении казни над служилыми людьми, убившими прикащиков Камчадальских острогов, с показанием количества ясачной казны, денег и запасов, оказавшихся в наличности после означенных прикащиков.
  "Памятники Сибирской истории XVIII века". Книга первая.1882г. Петербург. сс. 472-486